La sesta stagione della serie televisiva Smallville (6), composta da 22 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 28 Settembre 2006 al 17 Maggio 2007. Disponibile in Italia.
Trama di Smallville 6. Clark riesce a scappare dalla Zona Fantasma grazie all'iuto di Raya, ma insieme a lui prendono il largo anche alcuni detenuti rinchiusi da Jor-El che ora cercano vendetta e si scagliano sul figlio del loro carceriere. Un'altro Fantasma fa visita a Clark, un cacciatore di taglie proveniente dal pianeta Marte che è l'effettivo responsabile della cattura dei detenuti della Zona. Il Cacciatore afferma di essere stato amico di Jor-El e che si trova sulla Terra per aiutare Kal-El, il bambino che ha contribuito a salvare quando Krypton è andato distrutto. Lana sta aspettando un figlio da Lex, e nonostante ami ancora Clark decide di accettare la proposta di matrimonio e diventare la signora Luthor. In realtà la gravidanza è stata organizzata da Lex, che farebbe qualsiasi cosa pur di avere Lana. Alla vigilia del matrimonio Lana scopre il segreto di Clark e decide di non presentarsi all'altare, ma Lionel la ricatta costringendola a sposare suo figlio in cambio della vita di Clark. Un nuovo supereroe fa la sua apparizione a Smallville: Freccia Verde, alias Oliver Queen, un Robin Hood moderno che ha avuto la sfortuna di frequentare la stessa scuola di Lex Luthor. Chloe trova finalmente un nuovo amore: Jimmy Olsen, fotografo del Daily Planet, mentre Lois viene assunta all'Inquisitor e diventa ancora più spericolata. Lana finalmente scopre la verità sulla falsa gravidanza e decide di lasciare Lex, ma mentre si sta allontanando da Smallville la sua auto esplode in una pira di fiamme.
Clark è ancora intrappolato nella Zona Fantasma al posto di Zod, circondato dai criminali che Jor-El ha giudicato e condannato all'ergastolo. Fortunatamente viene liberato da un insospettabile alleato: Raya, assistente di Jor-El su Krypton che ha trovato rifugio nella Zona quando il pianeta è stato distrutto. Zod si è impossessato di Lex e rapisce Lana con l'intento di avere un erede da lei, nel frattempo sta progettando di trasformare la Terra nel suo dominio. L'aereo di Lois e Martha si schianta nei pressi della Fortezza della Solitudine e Jor-El da istruzioni a Martha su come eliminare Zod.
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Clark esce ogni notte per cercare di rimediare alla distruzione causata da Zod, ma i sensi di colpa continuano a pesargli sul cuore. Lois decide di intraprendere la carriera di giornalista e ottiene un lavoro all'Inquisitor. Lana si trasferisce al castello dei Luthor, ma chiede a Lex di eliminare le telecamere di sorveglianza dalla sua camera da letto. Lex avverte la sensazione di essere seguito; i suoi sospetti sono fondati e Lex viene rapito da due uomini che lavorano per Oliver Queen, una vecchia conoscenza di Lex ai tempi del college. Clark scopre di avere un nuovo potere, e lo scopre nel modo peggiore quando per sbaglio, con uno starnuto, fa volare via la porta del granaio destando i sospetti di Lois. Lana si accorge che Lex è sparito e grazie alle registrazioni delle telecamenre riesce a scoprire una traccia da verificare. Clark la segue di nascosto e arriva appena in tempo per salvare i due dalle fiamme con il suo nuovo potere.
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Jimmy Olsen, la nuova fiamma di Chloe, viene rapito da una creatura vegetale che si serve dei corpi umani per procreare. Lex, ancora oppresso dai sensi di colpa per il caos creato mentre era posseduto da Zod, organizza una serata di beneficenza in maschera e Oliver chiede a Lois di essere la sua dama per l'evento.
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Il misterioso Freccia Verde ruba una collana di diamanti a Martha e Lois e Clark uniscono le forze per scoprire la vera identità del ladro. Clark scopre che Oliver Queen è l'uomo che si nasconde dietro la maschera di Freccia Verde e che in perfetto stile Robin Hood, ruba ai ricchi per dare ai poveri. Lana riceve una visita da Lionel che la mette in guardia contro Lex, ma Lana non si fa intimidire, ma anzi si adopera per aiutare Lex ricattando il dottor Groll, lo scienziato che sta studiando i frammenti di un hard disk kryptioniano.
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Lex e Oliver partecipano ad una riunione di vecchi alunni e rimangono scioccati quando scoprono che gli amici di Oliver, con i quali si divertiva a tormentare Lex, stanno morendo uno dopo l'altro di morte violenta. Clark riesce a impadronirsi di alcune foto satellitari e scopre che altri quattro crateri si sono formati il giorno in cui lui è scappato dalla Zona...
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Dopo essere scappata dalla Zona Fantasma, Raya arriva a Smallville per fare visita a Clark. I due diventano amici e Raya aiuta Clark a riparare la Fortezza della Solitudine. Sfortunatamente Raya non è l'unica a essere scappata dai confini della Zona e Baern, un detenuto imprigionato da Jor-El, si mette sulle tracce di Clark per vendicarsi degli anni di prigionia. Lana si incontra di nuovo con il Dottor Groll il quale le consegna tutti i risultati dei test effettuati sulla scatola nera e le consiglia di stare il più possibile alla larga dai Luthor, svelandole che Lex ha già cominciato a testare la scatola come potenziale arma di distruzione.
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Freccia Verde rimane ferito mentre sta intervenendo in una rapina. Dopo essere rimasto colpito, Oliver comincia a comportarsi in modo strano. Clark viene a sapere dell'incidente ma Oliver nega tutto e afferma di stare bene. In realtà sta assumendo una droga per guarire che però comporta dei seri effetti collaterali. Lana sviene mentre si trova a pranzo con Chloe e si reca dal dottore per scoprire se c'è qualcosa che non va.
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Uno dei Fantasmi scappati dalla Zona, uccide l'equipaggio di una nave a Seattle. Clark cerca di fermare l'assassino che uccide per nutrirsi con le ossa delle sue vittime. Nel frattempo Lex scompare sotto gli occhi di Lana; il rapimento è a opera di uno degli uomini usati come cavie nei laboratori della LuthorCorp. Lana chiede aiuto a Chloe per ritrovare Lex e Chloe si rivolge a Clark, il quale però decide di indagare prima sulle morti di Seattle. Chloe e Lana ottengono l'aiuto del padre di Jimmy il quale riesce a capire che Lex è ancora nella villa, solo che non è percepibile perchè si trova su un'altra "frequenza" della realtà. Lana è sconvolta e teme che non lo rivedrà mai più e in un momento di disperazione confessa ad alta voce di essere incinta. Alla fine Lex viene tratto in salvo e chiede a Lana di sposarlo.
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Clark scopre che un suo vicino di casa, Jed McNally, è coinvolto nello sfruttamento degli immigrati clandestini. Clark si sente vicino alle povere vittime, sentendosi anche lui un clandestino sulla Terra. Chiede l'aiuto di Martha per permettere a una donna e a suo figlio di ottenere un permesso di lavoro. Lana e Lex discutono della proposta di matrimonio e Lex è pronto a concedere a Lana tutto il tempo che le occorre, nel frattempo le regala un viaggio a Amsterdam per visitare una prestigiosa collezione d'arte.
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Una giornalista del Daily Planet che si occupa della colonna dei pettegolezzi, usa il suo potere di trasformarsi in acqua per ascoltare le conversazioni riservate. Lana confessa a Chloe che non ha ancora accettato la proposta di Lex perchè prova ancora qualcosa per Clark; Linda Lake approfitta dell'occasione per scrivere un articolo bomba che porta Lana a credere che Chloe abbia venduto la loro amicizia. Nel frattempo Lois comincia a sospettare di Oliver e chiede aiuto a Clark per smascherare il suo segreto.
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Il Livello 33.1, il laboratorio segreto di Lex, produce finalmente i risultati tanto aspettati e Oliver si rende conto che è il caso di intervenire con tutta la potenza a disposizione: fa richiesta di aiuto agli amici di Clark che hanno dei poteri speciali e Arthur Curry, Bart Allen e Victor Stone rispondono prontamente all'appello. Chloe sta organizzando una vacanza con Jimmy mentre Lana, che ha accettato di sposare Lex, comincia ad abituarsi all'idea di essere la futura signora Luthor.
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Clark si ritrova rinchiuso in un ospedale psichiatrico dove gli comunicano che è affetto da una forma di schizofrenia paranoica. Tutta la sua vita è una menzogna: Krypton, i suoi poteri, i suoi nemici, tutto quello che credeva fosse la realtà è invece il frutto di una mente malata...
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Clark viene nuovamente esposto alla Kryptonite rossa quando Lois usa un rossetto a base di kryptonite. Le conseguenze sono disastrose: Lois si ritrova perdutamente innamorata di Clark, il quale ne approfitta per imbucarsi alla cena di fidanzamento di Lex e Lana, finendo per rapire la futura sposa sotto gli occhi di tutti.
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Mentre si trova nella sua camera nel castello dei Luthor, Lana riceve una foto sul suo cellulare, una foto scattata un attimo prima. Lex deve recarsi fuori città, ma lascia Lana nelle mani di un esercito di guardie private. Lana tuttavia, continua a ricevere misteriose telefonate e fotografie, quindi decide di nascondersi nell'unico posto che pensa sia davvero sicuro: la fattoria dei Kent.
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Tobias è un ragazzo rimasto cieco il giorno della pioggia di meteoriti, ma ha il potere di "vedere" gli altri mutanti affetti dalla kryptonite. Lex usa le abilità di Tobias per trovare persone con poteri speciali per poter effettuare esperimenti su di loro.
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Il giorno del matrimonio, Lana comincia ad avere dei ripensamenti in merito e anche Clark si sente angosciato dal'idea di perdere Lana per sempre. Nel frattempo il dottore che si occupa della gravidanza di Lana ricatta Lex minacciando di rivelare la verità sul bambino alla sua futura sposa. Lana escogita un piano per scoprire finalmente il segreto di Clark e quando il ragazzo usa i suoi poteri per salvare Chloe, Lana decide di lasciare Lex e di confessare il suo amore a Clark. Purtroppo Lionel non ha intenzione di permettere a Lana di spezzare il cuore di Lex e le intima di presentarsi all'altare minacciando di uccidere Clark con la kryptonite verde.
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Clark e Chloe scoprono un fuggiasco della Zona Fantasma, Titan, che usa i suoi poteri per diventare il campione imbattuto dei combattimenti mortali clandestini; i filmati degli incontri finiscono su internet e i due ragazzi riescono a rintracciare il locale dove si nasconde Titan. Clark si introduce nell'ambiente sotto copertura e fa in modo da essere il prossimo avversario di Titan, ma ha fatto male i suoi conti. Lana avverte dei dolori al basso ventre e viene ricoverata d'urgenza in ospedale dove le annunciano che ha perso il bambino.
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Lex scopre che la madre di Chloe è una delle persone con abilità speciali di Smallville: Moira ha la facoltà di controllare tutti i mutanti e Lex la rapisce costringendola ad aiutarlo in cambio della vita di Chloe. Clark aiuta Chloe a scoprire dove Lex tiene nascosta sua madre, ma Moira si difende bene e alla fine Lex è costretto a farsi indietro. Lana nel frattempo scopre una notizia scioccante sulla sua gravidanza.
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Lex rimane intrappolato in un labirinto di caverne sotterranee da Jodi Keenan che lo accusa di aver rapito suo marito. Clark si introduce nelle caverne per aiutarlo, ma la Kryptonite presente nei muri annulla i suoi poteri. Lex e Clark capiscono che l'unico modo per uscirne vivi è di collaborare. Nel frattempo Lana trova gli schemi delle gallerie sotterranee, ma decide di rivelarne l'esistenza soltanto dopo che Chloe le dice che anche Clark è sepolto sotto le rocce insieme a suo marito.
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Lana e Lionel si incontrano di nascosto al Daily Planet e mentre sta andando via Lana viene colpita da un proiettile. Jimmy, che era appostato per fotografare lo scoop, viene messo fuori combattimento e mentre è svenuto sogna di una Smallville del passato dove Clark è un reporter al Daily Planet, Lana è una donna avida che sta cercando di distruggere suo marito e Lois è una cantante che lavora in un pub di proprietà di Lionel. Una volta rinvenuto Jimmy scopre che le sue pellicole sono andate distrutte, inoltre riceve una promozione che lo porterà via da Metropolis.
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Lex continua gli esperimenti sul marito di Jodi Keenan, cercandolo di trasformarlo in un supersoldato. Il Senatore Burke ha scoperto il progetto di Lex e minaccia di divulgare la notizia alla stampa, Lex decide di eliminarlo usando il suo supersoldato, ma Lois assiste all'aggressione e diventa il prossimo obiettivo di Wes Keenan. Clark chiede aiuto a Lana e le chiede informazioni sul progetto segreto di Lex.
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Clark scopre il motivo che ha spinto Lana a sposare Lex e decide di occuparsi di Lionel una volta e per sempre. Lana annuncia a Lex che ha deciso di lasciarlo, rinfacciandogli di aver orchestrato la falsa gravidanza per costringerla a sposarlo. Lex non la prende bene e preso dall'ira la aggredisce fisicamente. Lana freddamente gli chiede se ha anche intenzione di ucciderla, visto che è l'unico modo in cui può continuare ad averla nella sua vita. Lex rimane scosso dalle sue parole e la lascia andare. Lana è al telefono con Lionel e lo informa che sta ha lasciato Lex e che sta partendo per allontanarsi da Smallville, ma mentre Lionel tenta di convincerla a non intraprendere azioni avventate, l'auto di Lana esplode. Clark arriva al castello e ha un chiarimento con Lionel; mentre gli sta causando un trauma cranico chiedendogli spiegazioni, arriva il Cacciatore di Taglie amico di Jor-El e svela a Clark che Lionel sta effettivamente lavorando per lui. Clark intuisce che Lionel gli sta nascondendo qualcosa e lo costringe a dire la verità sulla morte di Lana. Lois sta indagando sui laboratori segreti di Lex, una guardia la sorprende all'interno della diga e la pugnala. Lois, in fin di vita chiama Chloe che arriva sul posto trovando Lois ormai morta.
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