Fratello gemello di Daniel, dopo aver frequentato la South Salem High School dell'Oregon e la Brigham Young University si trasferisce per due anni in Giappone per una missione religiosa mormona. Tornato in America tenta la strada del cinema: recita in alcuni cortometraggi e appare sul grande schermo in Funky Town di Matthew Janzen, accanto al fratello gemello.
Il vero successo lo raggiunge nel 2004 con la commedia Napoleon Dynamite di Jared Hess: la parte è quella del teenager sfortunato deriso da tutti, che vive in una famiglia sopra le righe. Negli Stati Uniti la pellicola è un successo e Jon Heder diventa un personaggio di riferimento. Nel 2005 torna alla commedia demenziale con Se solo fosse vero e School for Scoundrels, fino a Blades of Glory nel 2007 nel ruolo di un pattinatore biondo platino accanto a Will Ferrell.
Lo rivedremo nel 2009 in When in Rome.
2007 Candidatura Miglior combattimento per Blades of Glory
2005 Premio Migliore perfomance musicale per Napoleon Dynamite
2005 Premio Migliore rivelazione maschile per Napoleon Dynamite
2007 Candidatura Migliore 'coppia' cinematografica per Blades of Glory
2007 Candidatura Migliore sequenza di ballo per Blades of Glory
2007 Candidatura Migliore attore in una commedia per Scuola per canaglie
2006 Candidatura Miglior combattimento cinematografico per Gli scaldapanchina
2006 Candidatura Migliore attore in una commedia per Se solo fosse vero
2006 Candidatura Migliore 'coppia' cinematografica per Gli scaldapanchina
2005 Premio Miglior 'attacco isterico' per Napoleon Dynamite
2010 Recitazione
2006 Recitazione
2007 Recitazione
2007 Recitazione
Il film sarà adattato in una miniserie animata di sei episodi dagli stessi autori della sceneggiatura originale e gli attori protagonisti della pellicola daranno le loro voci alle controparti bidimensionali.
Il giovane Paul Dano sarà protagonista del drammatico For Ellen dove interpreterà un musicista prossimo al divorzio.
L'attore americano sarà protagonista di 'Buddy Holly Is Alive and Well on Ganymede', una strampalata commedia sci-fi ispirata ad un'omonima graphic novel di Bradley Denton.
L'attore di Napoleon Dynamite sarà il protagonista di una nuova serie prodotta dal network americano, nel ruolo di uno specialista informatico che trovandosi senza lavoro, torna a vivere con i suoi genitori.
L'attore americano sarà protagonista di 'Woke Up Dead' una serie web prodotta dalla Electric Farm Entertainment.