La quarta stagione della serie televisiva MacGyver (4), composta da 19 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 31 Ottobre 1988 al 15 Maggio 1989.
Trama di MacGyver 4. Penny Parker compare nuovamente nella vita di Mac, portando scompiglio suo malgrado e diventando l'obiettivo di un pericoloso nemico in cerca di vendetta: Murdoc. Il micidiale assassino sembra essere finalmente uscito di scena, ma come l'araba fenice risorge dalla sue ceneri ancora una volta per cercare la sua vendetta. Pete sembra aver risolto i problemi con suo figlio, ma in realtà il ragazzo si è cacciato in guai seri... Jack chiede nuovamente l'aiuto del suo amico Mac, stavolta non per uno dei suoi soliti affari strampalati, ma per ritrovare la sua mamma.
MacGyver accompanga Penny Parker a visitare la casa che ha ereditato da sua zia Betty, morta misteriosamente 30 anni fa. Penny è convinta che la casa sia infestata dai fantasmi, ma ovviamente Mac cerca di convincerla che si tratta solo di una sua suggestione. Tuttavia, quando si trova di fronte a bizzarri incidenti, Mac comincia a sospettare che forse Penny non ha tutti i torti.
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Mac torna nella sua città natale, Mission City in Minnesota, per riunirsi con due vecchi amici, Chuck e Neil in occasione dell'aperta di una capsula del tempo che hanno seppellito insieme vent'anni fa. Mac tuttavia, è turbato all'idea di rituffarsi nel passato, a causa della morte di Jesse, avvenuta quando lui era ancora ragazzo. Nel frattempo i figli di Chuck e Neil, Sean e Danny, si sono invischiati con degli spacciatori di droga...
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Mac riceve soccorso da una famiglia di Amish che gli salva la vita. Per ricambiare il generoso gesto di solidarietà, Mac cerca di aiutarli con i problemi che stanno avendo con il governo che minacciano di fargli perdere la fattoria.
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Mentre si trova in America Centrale, Pete viene catturato insieme a una suora da un gruppo di guerriglieri ribelli. MacGyver e Jack partono per una missione di salvataggio, ma l'aereo di Dalton precipita nel bel mezzo del territorio nemico.
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Un amico di MacGyver rimane gravemente ferito in un incidente. Mac acconsente a sostituirlo per testare un nuovo motore di auto da corsa disegnato dalla Phoenix. Tuttavia la concorrenza ha altri piani in mente...
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Mac è impegnato con un nuovo incarico, verificare che gli agenti più anziani siano ancora in forma per operazioni sul campo. Il suo prossimo soggetto da testare è Pete. Durante la prova i due s'imbattono in un aereo abbattuto e due pericolosi contrabbandieri.
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MacGyver rimane coinvolto nelle ricerche di un serial killer evaso. Presto si scopre che l'uomo ha ricevuto aiuto da un altro detenuto, un uomo estremamente inquietante.
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Jack riceve notizie di suo padre da un mittente anonimo. In seguito a questo avvenimento, Dalton decide di mettersi in cerca di sua madre, scomparsa quando lui era ancora un bambino. Dopo averla ritrovata, scopre la donna è una fuggiasca, in pericolo di vita e la presenza di Jack non fa che complicare le cose.
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Penny Parker sta per avere la chance della sua vita, la svolta tanto attesa nella sua carriera professionale. Tuttavia una serie di incidenti mortali e la mancanza di fondi, minacciano di chiudere la produzione del musical dove lei è la protagonista.
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Michael, il figlio di Pete, torna a lavorare per la Fondazione Phoenix, ma ne' suo padre, ne' MacGyver, si accorgono che Michael sta usando i suoi contatti per impossessarsi di una nuova tecnologia per venderla al misterioso Papillion.
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Mac sta dando una mano a un'impiegata della Phoenix, il cui figlio è stato rapito dal padre. Purtroppo la faccenda si complica ulteriormente poichè il padre della vittima è il figlio di un vecchio boss della malavita, il cui trono è minacciato dai suoi subordinati.
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MacGyver presta il suo talento a un Centro giovanile che rischia di essere chiuso a causa di un residente della zona razzista, che non si ferma davanti a niente pur di ottenere i suoi scopi. L'uomo accusa uno dei ragazzi del Centro, un giovane di colore di furto d'auto, e il suo odio lo spinge perfino all'omicidio.
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Mac fa la conoscenza di una ragazza, Jennifer in arte Crystal. Jennifer è scappata di casa dopo la morte di sua madre, ed è finita sulla strada preda di un viscido individuo che la sfrutta. Grazie all'aiuto di Mac, Jennifer riesce a riappropriarsi della sua vita e Mac trova una nuova amica.
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MacGyver si unisce a una spedizione congiunta tra gli US e la USSR diretta in Alaska per recuperare un aereo Russo precipitato con un carico d'ore. Una volta arrivati sul posto però, scoprono che qualcun'altro li ha battuti sul tempo.
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MacGyver sta guidando un gruppo di quattro impiegati della Phoenix in una zona boschiva, viaggio che fa parte di un programma per la riduzione dello stress. Mentre sono sul posto, scoprono che un incidente d'auto ha liberato parecchi detenuti durante un trasferimento.
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Jack Dalton viene sottoposto ad una procedura mentale da un politico Africano e sua moglie per indurlo ad assassinare il leader di una nazione Africana in visita in città per ricevere un'onorificenza.
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MacGyver e Pete vengono catturati da un gruppo di terroristi. I criminali minacciano di usare un impulso elettromagnetico per mettere in ginocchio la città, a meno che il loro leader non venga liberato.
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Un ex soldato speciale della Marina, che ha salvato la vita di Mac, sta subendo gli effetti collaterali di una vecchia ferita alla testa. L'uomo ha rubato dell'Antrace e Mac deve fermarlo prima che la situazione degeneri in un disastro batteriologico.
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Jack, MacGyver e Pete ricordano le loro avventure ignari del fatto che un killer vendicativo è sulle loro tracce.
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