La seconda stagione della serie televisiva MacGyver (2), composta da 23 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 29 Settembre 2017 al 4 Maggio 2018. Disponibile in Italia dal 14 Giugno 2018 al 13 Agosto 2018.
Note:CBS ha rinnovato la serie per una seconda stagione il 23 Marzo 2017.
MacGyver, utilizzando un telefono cellulare e un pallone da calcio, si mette sulla tracce di un appartenente alle Forze Speciali della marina creduto morto che potrebbe invece essere vivo e tenuto prigioniero in Medio Oriente.
Usando una collana e un trasmettitore a microonde, MacGyver e il team tentano di localizzare Riley, in missione da sola per la prima volta con un pericoloso gruppo di hacker.
Il team va sotto copertura in un casinò, MacGyver, usando dei gemelli e un filo, cerca di rubare i diamanti dal caveau prima che un gruppo terrorista li usi per ottenere un'arma di distruzione di massa.
Quando Murdoc droga e rapisce MacGyver, Mac usa un ago e i suoi denti per fuggire e unirsi alla squadra per salvare la prossima vittima di Murdoc.
La squadra deve mettere da parte i piani per Halloween e dirigersi verso il temuto Triangolo delle Bermuda per recuperare il figlio del Vice Presidente dopo che il suo aereo è precipitato con un misterioso prigioniero a bordo.
MacGyver e la squadra vengono mandati in Nigeria per occuparsi di un incendio a un pozzo petrolifero appiccato dai ribelli che vogliono rovesciare il governo, distruggendo la risorsa più preziosa del paese.
MacGyver utilizza una stufa e della salsa di tabasco per aiutare un importante candidato alle elezioni presidenziali in Ecuador ad avere il trapianto di cuore di cui ha disperatamente bisogno, dopo che un gruppo di ribelli ha cercato di sabotare la consegna dell'organo.
MacGyver e il team devono rubare un dipinto dal valore inestimabile, usando una tovaglia e un laccio per scarpe, per stanare un mercante d'arte del mercato nero; Bozer frequenta un'accademia di addestramento per spie. Riley deve fare i conti con il ritorno del padre che non vedeva da tempo.
MacGyver, Dalton e Cage seguono un gruppo di mercenari indonesiani che trasportano una quantità letale di gas nervino sperando di risalire al loro capo. Bozer cerca di superare un test presso il centro di addestramento che lo porta a confrontarsi con un doloroso ricordo d'infanzia. Riley pensa di accettare l'invito a cena del padre.
MacGyver aiuta 32 studenti universitari intrappolati nell'Oceano Artico su una nave da ricerca. Bozer e Leanna si ritrovano ammanettati insieme nel corso di un nuovo test; Jack aiuta Elwood, ad affrontare il suo passato.
La polizia di Los Angeles interrompe le celebrazioni natalizie della squadra per arrestare MacGyver per terrorismo quando trovano un corpo in un edificio distrutto da una bomba costruita da Mac.
Mac e Jack sono intrappolati all'interno della casa di MacGyver, che la sua nemesi, “Il Fantasma”, ha imbottito di esplosivi. Mac usa un microfono karaoke e un trasformatore audio per far sapere alla squadra che la bomba a casa sua è destinata a distrarre le autorità da una bomba ancora più grande messa nel centro di Los Angeles.
Mentre Jack partecipa alla riunione del liceo gli altri partecipano a una competizione di veicoli droni progettata per aiutare i soldati feriti ad essere trasportati al di fuori dal campo di battaglia in sicurezza. Più tardi Mac deve aiutare una vecchia fiamma e concorrente a fermare il suo drone hackerato.
La squadra si dirige a New Orleans per rintracciare una truffatrice che si fa passare come la moglie di uno dei vecchi alias della CIA appartenenti a Jack. Durante le indagini i nemici del duca Jacoby, il suo pseudonimo, tornano per ucciderlo.
MacGyver e Jack prendono in custodia Murdoc, ma il suo mentore Nicholas Heldman è deciso a vendicarsi e lo sta cercando. Dopo essersi liberti di Heldman concedono a Murdoc di vedere suo figlio prima di essere nuovamente imprigionato, ma i due scappano.
Il figlio di un criminale di guerra serbo e la moglie vanno in luna di miele in un esclusivo castello francese. Leanna Bozer, MacGyver e Riley li seguono in incognito sperando di scoprire dove si trova il padre. Nel frattempo, Jack chiede al padre di Riley e a Jill della Phoenix Foundation di aiutarlo a entrare nella casa di Matty.
MacGyver, Jack e Riley devono trovare un mafioso, diventato un informatore ,che è stato rapito e portato a Cernobyl da un boss della criminalità internazionale. Bozer nasconde a Matty l’identità delle persone che hanno fatto irruzione a casa sua.
MacGyver e il team cercano un ex tecnico del governo che ha rubato informazioni riservate e si uniscono ai Colton, una famiglia di cacciatori di taglie, che sta cercando lo stesso uomo anche se per diversi motivi.
MacGyver e il team indagano sulla morte del supervisore di Dawn alla CIA e scoprono un agente corrotto e un enorme giro di falsari.
MacGyver e Jack tentano di salvare il figlio di un miliardario dopo essere stato rapito da un ex appartenente alle Forze Speciali della marina che ha usato un’arma a impulso elettromagnetico per tagliere la luce e le linee di comunicazione al grattacielo di Shanghai dove vive il ragazzo.
Mentre MacGyver è a Porto Rico per aiutare il suo amico a ricostruire la casa danneggiata dall'uragano, viene preso in ostaggio nella banca che il suo amico gestisce da che ladri stanno tentando di rubare 2 milioni di dollari.
MacGyver e Riley vengono attaccati da un gruppo di uomini mascherati dopo che il governo li ha chiamati per esaminare un oggetto misterioso che si è schiantato nel deserto del Nevada. Inoltre, Riley scopre nuove informazioni sul padre di Mac ma non sa se riferirle all’amico.
Quando MacGyver decide di lasciare la Phoenix Foundation, Matt gli dice che non ha l'autorità per approvare i licenziamenti. Mac scopre che la persona che ha quest’autorità non è altri che suo padre.