La seconda stagione della serie televisiva CSI: New York (2), composta da 24 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 28 Settembre 2005 al 17 Maggio 2006. Disponibile in Italia dal 11 Gennaio 2007 al 29 Marzo 2007.
Trama di CSI: New York 2. Il detective Mac Taylor e la sua squadra sono alle prese con nuovi e misteriosi casi da risolvere. Nel gruppo c'è una nuova arrivata, Lindsay Monroe, che prende il posto di Aiden, allontanata dopo aver compromesso alcune prove per incastrare uno stupratore. Alcuni casi coinvolgono da vicino i protagonisti, tra cui Danny, che viene accusato di un crimine, e Stella, che viene ferita in una tragica vicenda.
Paul Gizner è famoso per le sue scalate sui grattacieli, ma nel tentativo di scalare l'Empire State building precipita dal trentaquattresimo piano e muore. L'uomo potrebbe aver visto qualcosa che non doveva vedere. Sul caso indagano Mac Taylor e Sheldon Hawkes, passato da poco al lavoro di investigatore sul campo. Nel frattempo, Stella Bonasera e Danny Messer devono capire cosa è accaduto a Whitman Price, un designer di gioielli trovato morto con addosso un preziosissimo reggiseno di diamanti di sua creazione. Aiden invece è alle prese con un caso di stupro che la coinvolgerà emotivamente e la costringerà a fare i conti con la frustrazione per la mancanza di prove utili.
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Momenti di panico alla stazione centrale, nell'ora di punta, quando qualcuno lancia addosso al medico chirurgo Spencer Howard della soda caustica. Sulla sua morte cominciano ad indagare Mac e Sheldon. Stella e Danny invece si occupano del caso di Evelyn Danner, una scultrice non vedente che viene trovata morta strangolata. La carriera di Aiden è invece compromessa quando Mac scopre che la ragazza ha contaminato delle prove.
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Mac e Danny indagano circa la morte misteriosa di un uomo, sbranato da una tigre di uno zoo. Si scopre che la vittima, trovata con i polsi legati, è il nipote di un boss mafioso. A dare loro una mano c'è Lindsay Monroe, la nuova arrivata che prende il posto di Aiden. Stella e Sheldon invece indagano sull'omicidio di una ragazza trovata morta in una giostra di Central Park.
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La morte di Greg Thompson sembra l'esito di un cruento pestaggio. Dall'autopsia si scopre invece che i segni delle percosse sono post-mortem e che la vittima è stata uccisa da una scheggia di legno trovata nel cuore. Denny e Stella si occupano del caso, mentre Mac e Lindsay sono alle prese con un uomo trovato decapitato su una panchina del parco. Intanto Sheldon e il detective Flack cercano di far luce sulla morte di un ragazzino di 10 anni, campione di scacchi, avvenuta durante un incendio.
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Mac, Stella ed il detective Flack lavorano sul caso di una ballerina morta cadendo da un cavalcavia. Il ritrovamento di un biglietto vincente della lotteria, dal valore di diversi milioni di dollari, portano ad escludere l'ipotesi di suicidio. Danny e Sheldon sono invece alle prese con la morte di Fred Bayliss, trafitto al torace da una curiosa arma, un pesce spada. Nel frattempo Lindsay, indagando sulla morte di un manovratore di una teleferica, scopre un nesso con uno degli altri due casi.
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Mac, Danny e Lindsay cercano di capire chi ha ucciso un ricco uomo d'affari e soprattutto con quale arma. Infatti gli indizi balistici non consentono di risalire a nessuna arma da fuoco conosciuta. Elemento chiave per risolvere la vicenda potrebbe essere una ragazza che era insieme a lui, ma che ora è misteriosamente sparita. Stella e Sheldon Hawkes si occupano invece di un cadavere trovato nel lago di Central Park.
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Mac ed Horatio sono sulle tracce di Henry Darius, che è tornato a New York dopo aver seminato il panico a Miami. L'uomo ha con sé una ragazza in ostaggio.
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Joel Ivey muore poco dopo aver giocato una partita a poker con degli amici. L'assassino gli ha sparato da dietro la porta, direttamente nello spioncino, centrando la vittima in pieno viso. Mac, Stella e Lindsay si occupano del caso, sospettando di uno dei giocatori che era stato allontanato dagli amici perché sorpreso a barare. Intanto Danny e Sheldon si occupano della morte di Tara Stansfield, una conduttrice televisiva.
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Russell McCulley, specialista nella riparazione di bambole, viene trovato morto nel suo negozio. Un segreto celato in una bambola, dotata di un meccanismo per registrare messaggi vocali, potrebbe portare a galla la verità. Stella e Sheldon indagano sulla morte di Lauren Redgrave, una ragazza che era malata di cancro, che non presenta segni di violenza nonostante i vicini dichiarino di averla sentita litigare con qualcuno.
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Una pattinatrice, Rose Wilson, rimane uccisa durante una gara. Mac, Stella e Lindsay dovranno stabilire se a colpirla è stata una delle avversarie oppure una delle sue compagne. Intanto in un parco viene rinvenuto il cadavere di Griffin Holden, giovane scrittore, avvolto in un costoso tappeto. Danny e Sheldon cercano di capire quale mistero sta dietro le scritte che con una lampada UV ritrovano su tutto il corpo, forse l'ultimo capitolo del libro a cui la vittima stava lavorando.
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Questa volta Mac Lindsay e Sheldon sono alle prese con la morte di una spogliarellista ritrovata stesa sul vetro di un riflettore e con gravissime ustioni sulla superficie del corpo. Stella e Danny indagano invece sull'assassinio del miliardario Hunter Hudson, trovato sgozzato in casa sua. Le cose si complicano quando Danny rimane intrappolato dentro la stanza blindata in cui si trova il cadavere, la cui porta non si riaprirà prima di 13 ore. Non avendo con sé il kit, teme di perdere importanti prove a causa del deterioramento progressivo della vittima.
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Una modella, dopo aver avuto un diverbio con il suo stilista, muore durante una sfilata. Ad occuparsi del caso sono Mac, Danny e Sheldon, mentre al distretto il detective Flack è alle prese con un uomo che confessa di aver ucciso una dottoressa, consegnando la pistola. Stella e Lindsay trovano la vittima, ma ci sono parecchi punti oscuri, compreso il fatto che il corpo della donna è ricoperto da sanguisughe.
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Danny scorge un corpo sulle rotaie della metropolitana e riesce a far fermare la vettura al macchinista. Dall'autopsia emergono particolari estremamente bizzarri, come alcuni pesci esotici nello stomaco, ingoiati vivi, e un dente di squalo nella mano. Stella, Sheldon e Flack si occupano invece di un agente di borsa trovato morto impiccato.
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Mac, Stella e Sheldon indagano sulla morte di una ragazza che durante una mostra si era appartata con il milionario Carlo Franchetti. I due vengono infatti trafitti da una freccia che uccide lei e ferisce lui; curiosamente dalle analisi risultano esserci sulla freccia delle tracce di sangue di giaguaro. Altrettanto misterioso è il ritrovamento di un promoter musicale trovato morto con la faccia ricoperta di colla e un proiettile in gola.
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Mac, Stella e Lindsay devono svelare un mistero: Kyle Vance è stato ucciso in un cimitero da uno sparo, ma non c'è né foro di uscita, né un proiettile nel corpo. Scoprono che l'uomo era coinvolto in uno strano gioco in cui tutti i concorrenti dovevano riuscire ad eliminarsi utilizzando dei palloncini pieni d'acqua. Danny e Sheldon invece lavorano al caso di Kathleen Dunley, trovata morta nel suo letto, legata e bendata: curiosamente nel suo orecchio ci sono uova di millepiedi.
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Quando dai rubinetti di un palazzo di Manhattan inizia a uscire sangue, viene rinvenuto il cadavere di una donna nel serbatoio idrico sul tetto. L'edificio è già conosciuto per altre sei morti sospette, avvenute negli ultimi dieci anni. Qualcosa potrebbe legare tutti questi decessi. Il secondo caso riguarda lo strangolamento di un ragazzo che stava pedinando e fotografando una donna.
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Una donna viene trovata morta nel museo presso cui lavorava, coperta da insetti che le stanno divorando il corpo. L'unico testimone dell'accaduto è un bambino di sei anni, i cui ricordi confusi fondono insieme gli avvenimenti reali con quelli immaginari del fumetto che stava leggendo. Danny e Flack si occupano della morte di un uomo ucciso in un cantiere edile, probabilmente a causa di una associazione di giocatori di golf che usano la città come campo da gioco.
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Mac e gli altri colleghi devono affrontare una corsa contro il tempo: l'obiettivo è recuperare un fegato rubato entro 12 ore, altrimenti il paziente in attesa del trapianto morirà. Nel frattempo, Stella e Lindsay indagano sullo stupro e l'uccisione di una donna.
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Clark Kranen viene trovato morto in un vicolo con indosso un costume da supereroe. L'uomo infatti aveva cercato di agire come Superman per salvare una persona da un rapinatore, cambiandosi in una cabina telefonica. Mac, Stella e Sheldon cercano di trovare l'assassino, mentre Danny e Lindsay indagano sulla morte di un famoso giocatore di football, Tyrell Mann, soprannominato "Super Mann" per le sue eccezionali capacità.
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Danny è nei guai quando diventa il primo sospettato in un caso che riguarda i Tanglewood Boys, a causa di alcune prove che lo collocano sulla scena di un crimine avvenuto 15 anni prima. Mac si dà da fare per individuare il vero colpevole. La vicenda intanto dà la possibilità a Danny e a suo fratello Louie di chiarire alcuni avvenimenti dolorosi del passato. Il secondo caso riguarda invece un banchiere trovato accoltellato in una stanza d'albergo.
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Stella è vittima di una tragedia: nel suo appartamento viene ritrovato il suo ragazzo Frankie morto mentre lei è priva di sensi, con tagli e ferite su tutto il corpo. Le prove balistiche indicano che è stata lei a sparare a Frankie, ma Stella ancora sotto shock ricorda in maniera molto confusa gli avvenimenti. Nel frattempo Danny e Lindsay indagando sull'omicidio dell'autista del cantante Kid Rock.
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Mac, Stella e Sheldon si occupano del caso di Mark Jeffries, trovato morto con un foro di proiettile nell'occhio destro. La vicenda diventa ancora più curiosa quando sulla scena del crimine si presentano due donne, che dichiarano entrambe di essere sposate con la vittima. Lindsay invece indaga su un caso che la coinvolge particolarmente, dato che la vittima è originaria del Montana come lei. La donna che viene ripescata dall'acqua ha indosso un costume da sirena e presenta dei segni di strangolamento.
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Mac e Danny indagano sull'omicidio di un caporale dei Marines accoltellato in Central Park. Stella, Sheldon e Lindsay devono invece risalire all'identità di una donna, trovata carbonizzata all'interno di un'auto. L'intera squadra CSI deve affronterà una tragica scoperta quando verrà emesso il responso della ricostruzione facciale.
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Mac e la sua squadra affrontano una corsa contro il tempo: hanno solo poche ore a disposizione per rintracciare un pericoloso dinamitardo che minaccia New York. L'uomo, che usa tecniche e ordigni di tipo militare, sembra conoscere molti particolari del passato di Mac, soprattutto alcuni tragici eventi della sua carriera nei Marines.
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