La terza stagione della serie televisiva Bones (3), composta da 15 episodi, è stata trasmessa per la prima volta dal 25 Settembre 2007 al 19 Maggio 2008. Disponibile in Italia dal 15 Dicembre 2008 al 19 Gennaio 2009.
Trama di Bones 3. Angela e Hodgins sono in cerca del primo marito di lei per ottenere il divorzio e procedere con i loro piani matrimoniali. Max Keenan è in prigione e deve affrontare il processo per l'omicidio di Kirby; Temperance si offre come consulente per la difesa, mettendo a disposizione tutta la sua abilità per aiutare suo padre, purtroppo l'accusa ha dalla sua tutti i membri della squadra del museo. Cam chiede a Seeley di interpretare la parte del suo ragazzo a una riunione di famiglia, ma la recita si limita davvero a una serata con i parenti? Zach fa ritorno a casa, ma rischierà la vita per causa di un'esplosione al Jeffersonian, un attentato che porta la firma di un serial killer che la squadra ha già incontrato in diverse occasioni.
Un teschio si schianta sul parabrezza di un'auto mentre sta attraversando l'autostrada. Esaminando il teschio, Brennan e Cam scoprono dei segni lasciati da denti umani, focalizzando le indagini su una società segreta dedita al cannibalismo. Nel frattempo Angela e Hodgins si rivolgono a un investigatore privato per rintracciare il primo marito di Angela, mentre Zach fa ritorno al Jeffersonian giusto in tempo per scoprire una prova cruciale per la risoluzione del caso.
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Brennan e Booth indagano sulla morte di una donna di nome June che è saltata in aria con il suo furgoncino. Spiazzati da quello che sembra un omicidio senza movente, i due presto scoprono che la donna faceva parte di un gruppo di estremisti negli anni '70. June inoltre, era ricercata dall'FBI e le prove indicano che era intenzionata a costituirsi, fatto che contribuisce a infittire il mistero. Nel frattempo Temperance va in prigione per fare visita a suo padre.
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La squadra indaga su un corpo in decomposizione ritrovato nei boschi con le braccia legato e un piede mancante. Angela si rivolge all'ipnosi per ricordare il nome dell'uomo che ha sposato, in modo da poter finalmente ottenere il divorzio.
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Booth e Bones esaminano un corpo ampiamente decomposto ritrovato da alcuni ragazzi nel terreno dove poggia un ospedale. L'uomo risulta essere Franklin Curtis, il fondatore di una catena di supermercati di prodotti biologici e le analisi indicano che il corpo è stato incenerito o ...cucinato. Booth e Temperance interrogano i vicini della fattoria di Curtis mentre in laboratorio i ragazzi scoprono che insieme al corpo di Curtis ci sono i resti di un'altra persona. Nel frattempo Booth e Brennan vengono assegnati a un nuovo psicologo.
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Booth e Brennan indagano sul caso di due corpi mummificati ritrovati in due attrazioni tipiche di Halloween. I corpi si trovano in due differenti stadi di decomposizione e la squadra si rende conto che ha a che fare con un serial killer. Booth e Brennan vengono a sapere della scomparsa di un'altra ragazza e trovano un collegamento ai due primi casi. In corsa contro il tempo, i due cercano di catturare l'assassino prima che compia un altro sacrificio per la prossima notte di Halloween.
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I resti di un impiegata del Jeffersonian vengono ritrovati nell'inceneritore dell'edificio, costringendo la squadra a indagare sui colleghi del museo. All'inizio si sospetta che la donna sia stata uccisa perchè stava lavorando su un oggetto collegato al caso del Figlio della Vedova, ma le cose si complicano quando si scopre la sua relazione con un altro impiegato del Jeffersonian. Nel frattempo Booth fa un favore a Cam fingendo di essere il suo ragazzo durante una riunione di famiglia.
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Una capsula del tempo risalente al 1987, viene riportata in superficie durante una riunione scolastica degli ex alunni. Una volta aperta si scopre al suo interno il cadavere di uno degli studenti. Booth e Brennan scoprono che la vittima era un emarginato e concentrano le loro indagini sul passato dei suoi compagni di classe, sperando di trovare un movente e l'autore dell'omicidio.
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Il corpo di un arcivescovo viene rinvenuto da alcuni operai edili. Le rotule della vittima sono state rimosse chirurgicamente e la squadra ricollega il caso a quello del Figlio della Vedova.
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Booth e Brennan indagano su un Babbo Natale di nome Kris Kringle che lavorava in un centro commerciale. Il corpo di Kringle viene scoperto da due 'elfi' e durante le indagini una serie di indizi sembrano indicare che l'uomo sia il vero Babbo Natale...
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Il cadavere di un uomo viene scoperto in un Centro Benessere di Acque Termali, in una sorgente di fanghi. Booth e Brennan si recano sul posto per raccogliere indizi sulla scena del crimine e identificano il corpo. La vittima era Tripp Goddard, un motociclista ucciso due settimane prima dopo aver partecipato a una gara.
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La squadra è impegnata nell'identificazione delle ossa di un atleta rimaste schiacciate dalle panchine meccaniche della palestra. La vittima era un astro nascente dello sport, RJ Manning e le prove indicano che è stato assassinato. Booth e Brennan seguono una serie di piste e scoprono che l'omicidio potrebbe essere stato commesso da più persone.
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Un'auto viene mandata fuori strada e la donna al volante rimane uccisa, ma suo figlio sopravvive miracolosamente all'incidente. Booth e Brennan si prendono cura del piccolo mentre la squadra cerca di scoprire come sono andati i fatti e chi è responsabile per la morte della madre.
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Max Keenan è sotto processo per l'assassinio di Kirby. Tutti i membri della squadra, eccetto Temperance, sono chiamati a testimoniare per l'accusa. Brennan è la consulente per la difesa e deve usare tutta la sua abilità per aiutare suo padre a ottenere la libertà.
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Un aspirante cantante, Tommy Sour, viene ritrovato morto. Le indagini conducono Brennan, Booth e Cam al ristorante dove Tommy era solito esibirsi. I tre interrogano i rivali di Tommy che hanno preso parte a una sfida canora, compreso una donna che era ossessionata dalla vittima, ma che dopo aver saputo della sua morte, riversa la sua attenzione su Booth. Mentre lavora al caso, la squadra rimane sconvolta da un terribile avvenimento.
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Il Serial Killer Gormogon è tornato di nuovo e lo scheletro d'argento scompare dalla cassaforte del seminterrato. Un'esplosione al laboratorio manda Zach all'ospedale e tutti gli impiegati dello Jeffersonian sono sospettati. Durante le indagini emerge la possibilità che uno di loro stia lavorando a stretto contatto con il killer
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Ancora vampiri in TV con il debutto di Moonlight su Italia Uno, ma anche indagini con la terza stagione di Bones e teen dramas con La vita segreta di una teenager americana e High School Team - Friday Night Lights.
Una panoramica sulle avventure e disavventure che travolgono l'Agente Speciale Booth e la sua antropologa preferita nel corso della terza stagione della serie.